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--- genetik:populationsmanagement [2025/08/19 14:59] – [Verlust der genetischen Variabilität einer Population] kathrin
+++ genetik:populationsmanagement [2025/11/05 20:50] (aktuell) – [Stammbaum-Analyse] kathrin
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 ==== Stammbaum-Analyse ====
-Eine kontinuierliche Dokumentation von Stammbäumen erlaubt die Berechnung von Inzuchtkoeffizienten F<sub>PED</sub> oder verwandten Parametern. Dabei entscheidet die Qualität der Stammbäume maßgeblich über die Aussagekraft der erhaltenen Schätzwerte.
+Eine kontinuierliche Dokumentation von Stammbäumen erlaubt die Berechnung von Inzuchtkoeffizienten F<sub>PED</sub> oder verwandten Parametern. Dabei entscheidet die Qualität der Stammbäume maßgeblich über die Aussagekraft der erhaltenen Schätzwerte. Verwandtschaftsverhältnisse zwischen Gründertieren bleiben jedenfalls unberücksichtigt.
+Beispielhafte Stammbaum-Analysen:\\
+  * Sakthivel //et al//., 2018((Sakthivel, M., Balasubramanyam, D., Kumarasamy, P., Raja, A., Anilkumar, R., Gopi, H., & Devaki, A. 2018. Genetic structure of a small closed population of the New Zealand white rabbit through pedigree analyses. World Rabbit Science, 26(2), 101-112.)) -- geschlossene Population Weißer Neuseeländer (SBRS // Sheep Breeding and Research Station//, Indien);
+  * Rahim //et al//., 2022((Rahim, A., Rajaravindra, K. S., Chaturvedi, O. H., & Sharma, S. R. 2022. Assessment of population structure and genetic diversity of German Angora rabbit through pedigree analysis. Animal bioscience, 36(5), 692.)) -- geschlossene Angorakaninchen-Population (//German Angora//, NTRS ICAR-CSWRI //Central Sheep and Wool Research Institute//, Indien).
 ==== Genomische Analyse ====
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 So können etwa sogenannte **Runs of Homozygosity (ROH)** - kontinuierliche Chromosomenabschnitte, in denen alle Loki einen homozygoten Genotyp aufweisen - ein präzises Maß für die genomische Inzucht eines einzelnen Tieres (F<sub>ROH</sub>) liefern. Auf Populationsebene können ROH Hinweise auf die genetische Geschichte der Populationen liefern. ROH können weiters genutzt werden, um genomische Signaturen zu identifizieren: gehäufte ROH in bestimmten Chromosomenregionen (//ROH islands//, ROH-Inseln) weisen auf eine reduzierte Haplotypen-Variabilität hin.((Peripolli, E., Munari, D. P., Silva, M. V. G. B., Lima, A. L. F., Irgang, R., & Baldi, F. 2017. Runs of homozygosity: current knowledge and applications in livestock. Animal genetics, 48(3), 255-271.))((Ballan, M., Schiavo, G., Bovo, S., Schiavitto, M., Negrini, R., Frabetti, A., … & Fontanesi, L. 2022. Comparative analysis of genomic inbreeding parameters and runs of homozygosity islands in several fancy and meat rabbit breeds. Animal Genetics, 53(6), 849-862.))\\
-Das Vorhandensein langer ROH-Segmente ist ein Hinweis auf jüngst stattgefundene (enge) Inzucht, während kürzere ROH den Einfluss entfernter Vorfahren widerspiegeln.\\
+Das Vorhandensein langer ROH-Segmente ist ein Hinweis auf jüngst stattgefundene (enge) Inzucht, während kürzere ROH -- aufgrund von Rekombination -- den Einfluss entfernter Vorfahren widerspiegeln.\\
 Der individuelle Inzuchtkoeffizient F<sub>ROH</sub> entspricht dem Verhältnis der Gesamtlänge aller ROH zur Gesamtlänge des Genoms. (Je größer F<sub>ROH</sub> ist, umso mehr Erbanlagen liegen in Folge von Inzucht reinerbig vor.)